Présentation de l'agence : 

Santé publique France est l’agence nationale de santé publique française. Etablissement public de l’Etat sous tutelle du ministre chargé de la santé, issu de la fusion de plusieurs établissements publics, créé par l’ordonnance 2016-246 du 15 avril 2016, l’agence intervient au service de la santé des populations. Agence scientifique, d’expertise et de sécurité sanitaires, elle a pour missions :

1° L'observation épidémiologique et la surveillance de l'état de santé des populations ;
2° La veille sur les risques sanitaires menaçant les populations ;
3° La promotion de la santé et la réduction des risques pour la santé ;
4° Le développement de la prévention et de l'éducation pour la santé ;
5° La préparation et la réponse aux menaces, alertes et crises sanitaires ;
6° Le lancement de l'alerte sanitaire.

L’agence est organisée autour de 12 directions scientifiques, transversales ou assurant le soutien à l’activité.

Les orientations stratégiques de l’agence et son programme de travail, arrêtés par son Conseil d’administration, se déclinent en trois axes :  Consolider la capacité d’anticipation et de réponse réactive pour faire face aux menaces sanitaires ; Mesurer et évaluer l’ampleur des maladies et des facteurs de risques pour guider leur prévention et leur contrôle ; Renforcer l’impact sur la santé dans toutes les politiques publiques et la prévention et promotion de la santé.

Affectation : 

La Direction des maladies non transmissibles et des traumatismes assure la surveillance épidémiologique des maladies non transmissibles et des traumatismes, de leurs principaux déterminants ainsi que de leurs complications. Ses missions contribuent à plusieurs plans nationaux et s’inscrivent dans les priorités de la Stratégie Nationale de Santé et la stratégie de santé outre-mer. En 2015, dans le monde, on estime que les maladies non transmissibles sont responsables de 71% de la mortalité prématurée. En France les maladies non transmissibles représentent le fardeau de santé publique le plus lourd en termes de morbidité et de mortalité.

L’unité Cancer compte 10 agents permanents et un responsable d’unité. Ses activités couvrent le champ de la surveillance épidémiologique des cancers, dont la gestion des suspicions de clusters de cancers, et de l’évaluation de la performance des programmes nationaux de dépistage organisé des cancers. L’équipe surveillance repose sur une équipe de trois épidémiologistes, un biostatisticien, et du temps du responsable de l’unité cancer.

Les activités de surveillance sont conduites en collaboration étroite avec l’Institut national du cancer (INCa), le réseau Francim des registres des cancers et le service de biostatistique-bioinformatique des Hospices civils de Lyon. Elles s’appuient sur plusieurs sources de données dont celles du SNDS et des registres de cancers et visent à contribuer à la stratégie décennale de lutte contre les cancers via le suivi de nombreux indicateurs dont l’incidence, la mortalité et la survie associés aux différents types et localisations de cancers.

Celles d’évaluation de la performance des programmes de dépistage organisé s’appuient sur des échanges pérennes avec les centres régionaux de coordination des dépistages des cancers (CRCDC), l’Assurance maladie et l’INCa.

Dans le cadre de la réponse à un appel à manifestation d’intérêt de la bibliothèque ouverte des algorithmes en santé (BOAS) du Health Data Hub (HDH), l’unité cancer va étudier l’identification des cancers cutanés à partir des différentes prestations (actes ou prescriptions) contenues dans les différentes bases du SNDS et valider les algorithmes d’identification en les confrontant aux cas de mélanomes cutanés validés par trois registres de cancers. 

Missions : 

Rattaché(e) à l’unité Cancer, sous la responsabilité de la responsable d’unité, le data scientist aura pour mission de contribuer à développer, en collaboration avec les partenaires, des algorithmes d’identification des cancers cutanés à partir de données appariées. Après validation des algorithmes, le data scientist appliquera les algorithmes validés pour réaliser les estimations d’incidence (et, le cas échéant de prévalence) des cancers cutanés au niveau national et infranational.

Activités : 

- Participer aux réunions collaboratives entre les différentes partenaires (Health Data Hub, registres des cancers, comité d’appui thématique, etc.).

- A partir des données des différentes bases de données du SNDS : 1/ isoler les lignes de prestations (consultations, actes de chirurgie, actes de biologie, actes d’imagerie, médicaments…) dans les différentes bases de données du SNDS (DCIR, PMSI) ; 2/ reconstruire les phases de diagnostic et de traitements des assurés pris en charge pour une lésion suspecte de cancers cutanés ; 3/ participer à l’élaboration des algorithmes a priori.

- Participer à l’évaluation des performances de ces algorithmes (par confrontation avec les cas validés par les registres des cancers).

- Après validation des algorithmes : appliquer les algorithmes ayant des performances jugées satisfaisantes pour estimer l’incidence (et, le cas échéant, la prévalence) des cancers cutanés, au niveau national et infranational.

- Rédiger la documentation relative à la constitution de ces algorithmes.

- Présenter les résultats intermédiaires et finaux aux partenaires 

- Mettre à disposition, dans un cadre collaboratif, la documentation sur les algorithmes et les programmes dans l’infrastructure du HDH pour alimenter la BOAS.

- Participer à la valorisation des travaux (articles scientifiques, présentations en congrès…)

Profil recherché : 

- A partir de Bac +3, Bac+5 souhaité

- Ingénieur, master 2 data science / traitement de l’information, master 2 de bio-statistiques

- Expérience appréciée dans l’exploitation de bases de données complexes dont les données du SNDS

Aptitudes et compétences : 

Il est attendu pour ce poste :

- Formation et habilitation SNDS (sinon la possibilité de son obtention sera étudiée)

- Compétence en gestion des bases de données relationnelles et connaissance du langage SQL 

- Compétence en data-management 

- Expérience en analyse de bases de données complexes (SNDS), y compris analyses statistiques

- Maîtrise des logiciels de statistiques (SAS ou R) et bureautique (Word, Excel, Power-Point, Outlook), indispensable

- Être force de proposition sur le data-management, les analyses statistiques et la visualisation des résultats

- Organisation et rigueur, autonomie, esprit d'initiative

- Aptitude au travail en équipe, capacité relationnelle 

- Capacité de communication orale et écrite